Povijest visokoga školstva na ovim prostorima zapoèinje prije gotovo tri stoljeæa - 1707. godine, kada je u Osijeku osnovana prva visokoškolska ustanova, i to bogoslovna visoka škola, koja je zapoèela svoj redoviti rad školske 1707./1708. godine kao Studium Philosophicum Essekini, trogodišnji visokoškolski studij odnosno uèilište filozofije.
Inicijativa za osnivanje Sveuèilišta u Osijeku pokrenuta je 1975. godine, te valja istaknuti da je 26. ožujka 1975. godine Hrvatski sabor donio Odluku o davanju suglasnosti za osnivanje Sveuèilišta u Osijeku, a dva mjeseca kasnije, 31. svibnja 1975. godine potpisan je Sporazum o osnivanju Sveuèilišta u Osijeku, èiji potpisnici su bili: Ekonomski fakultet, Poljoprivredno-prehrambeno-tehnološki fakultet, Poljoprivredni institut, Fakultet strojarstva i brodogradnje iz Zagreba za Studij strojarstva u Slavonskom Brodu, Pedagoška akademija u Osijeku, Muzièka akademija u Zagrebu za Odjel glazbe u Osijeku, Gradska knjižnica i Povijesni arhiv u Osijeku.
Stoga 31. svibnja obilježavamo kao dan osnivanja Sveuèilišta.
Godine 1982. osnovan je Fakultet graðevinskih znanosti, 1990. Studij elektrotehnike prerastao je u Elektrotehnièki fakultet, a iste 1990. godine Sveuèilišna skupština donosi Odluku o unošenju imena Josipa Jurja Strossmayera u naziv Sveuèilišta i tako najmlaðe hrvatsko sveuèilište nosi ime iznimno važne osobe za hrvatsku i europsku kulturu.
U povijesnom prikazu Sveuèilišta valja istaknuti da je 1995. godine osnovan Studentski centar u Slavonskom Brodu, a 1998. godine osnovana je, nakon 19 godina postojanja dislociranog Studija medicine u Osijeku, samostalna ustanova Medicinski fakultet u Osijeku.
Uredbom Vlade Republike Hrvatske 1998. godine osnovana je Visoka uèiteljska škola u Osijeku, a iste godine izdvojeni su struèni studiji iz fakulteta i ustrojeni su na Veleuèilištu u Požegi.
Godine 1999. osnovan je Odjel za matematiku kao podružnica Sveuèilišta, a iste godine ustrojen je dislocirani Uèiteljski studij u Slavonskom Brodu i otvoren Studentski dom u Slavonskom Brodu.
Na temelju dopusnice Ministra znanosti i tehnologije u akademskoj 2001./2002. godini struèni studiji iz ekonomije, prava, elektrotehnike, graðevinarstva, poljoprivrede i strojarstva izvode se na osjeèkim fakultetima, dislocirani struèni studij ekonomije izvodi se u Varaždinu, te dislocirani studij elektrotehnike u Požegi i dopunski dislocirani studij knjižnièarstva u Zadru.